外文如何引物中文文献

外文如何引物中文文献

问:引物是自己设计好还是从文献里面找好呢?
  1. 答:可靠的英文文献是可以直接用的,有现成的引物和条件,一般是好用的。这还要结合实验目的,一样的目的可以套用,否则最好自己设计。
  2. 答:当然是外文文献里的了
问:我之前是自己设计的引物,可是没有扩增出来片段,最后就选择用文献中的引物。
  1. 答:别人东西可以引用的 但不能让别人认为你是照抄照搬没有创新 引物相同后续后续的不同也可以的
    在参考文献中你一定要表明你的那个文献的引用 不然别人就会认为你侵权啦
    个人意见。。纯属参考吧
  2. 答:当然可以用别人引物啦 我一般做real time的引物都是搜文献报道的 这样才有保证 这个不存在侵权问题的
问:文献上看到一种蛋白,有基因序列号,可是上genbank blast一下,只有它自己,怎么设计引物?
  1. 答:有基因序列号,你就可以直接上genebank下载其序列,下载到全序列,你需要扩增的CDS区,也就是编码区,可以全外显子扩增,这样简单一点,也可以做cDNA克隆,然后再做,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号设计引物,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物。
问:用别人的pcr引物怎么在论文中说明
  1. 答:如果你要扩增一个已经报道过其扩增引物的片段,当然是用文献报道的引物来扩增,因为人家报道的都是经过筛选的效果好的引物,一般成功率高。如果是扩增一个没有引物报道的序列,那只能是自己设计了。
问:求常用的植物actin基因序列或引物,山茶科的更好(查了文献没查到),文献里的引物序列用括号括起来是什么
  1. 答:植物大麦、玉米等actin 714bp
    F 5'-CTCGACTCTGGTGATGGTGTG-3’
    R 5'TTGGAGAT-3’
    括号是简并引物的意思,即合成引物时,该位置会随机添加其中一个:
    5‘-CAGATGGC(GT)GA(CT)GGTGAAGA(TC)AT-3’的一个可能是:
    5‘-CAGATGGC G GA C GGTGAAGA T AT-3’自己排列组合一下就是。
    送引物合成的时候序列如下:
    5‘-CAGATGGCKGAYGGTGAAGAYAT-3’
  2. 答:通常actin基因用于基因表达定量的内参。不同植物的actin序列不同,必须找到同种植物的actin序列做参考;可以在Genbank中查找;也可根据文献查找。其他的持家基因housekeeping基因都可以作为内参基因。引物序列中的括号内的序列为简并碱基,即在括号内的位置,存在两种碱基,如上述括号内的(G/T)。
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